初入朝廷
明嘉靖四十四年(1565)，知县辟书院，令高材生从袁受经学。万历五年(1577)会试，初拟取第一，因策论违逆主试官而落第。后更名黄。十四年中进士，为万历初嘉兴府三名家之一。奉命清核苏松钱粮，上《赋役议》，又请减免额外加征米银10余条款，被豪绅所阻而作罢。任河北宝坻知县，时该县赋役倍于他县，积欠粮赋达万石，袁黄上条陈请减免旧额，建议由会通河水运皇木代替车运，朝廷允准。于是宝坻（今天津市宝坻区）得以减免旧赋，革除运木重夫、重马、采石及箭手诸劳役。袁黄还下令疏浚河道，植树挖沙，筑堤开渠，垦荒种植，成绩斐然。时蓟镇诸主、客军近20万，年例银及屯田民运各项开支计150万两，巡抚因袁黄通晓边疆事宜，遂召之共议大计，乃献革养军虚费、汰台兵冗员等十策。
入军
万历二十年(1592)，调任兵部职方主事，适日本侵略朝鲜，朝廷大举东征，蓟辽经略宋应昌上疏请袁黄到军营赞划，与刘黄裳浮海渡鸭绿江。平壤战役时，提督李如松以诱兵迎战日军获胜，袁黄禁止李部下诸将割首级报功，李深为恼恨而引兵东去，派袁黄守平壤，不增拨一兵一卒。后突遇日军攻城，袁黄率领部下及3000名朝鲜兵击退之。不久，李如松兵败碧蹄馆，兵部尚书石星主张拨款议和，袁黄上书提出将骄应罢兵。提督李如松诬袁黄以十大罪状，袁黄遂罢归家居，闭户著书。卒年74岁。天启元年(1621)，吏部尚书赵南星追叙袁黄东征功勋，赠尚宝司少卿。清乾隆二年(1737)入祀魏塘书院六贤祠，浙江巡抚纳兰常安撰《祠堂记》，赞袁黄“挥击阉竖，九死不悔”。
著述
有：《祈嗣真诠》、《皇都水利考》、《评注八代文宗》、《春秋义例》、《论语笺疏》、《袁氏易传》、《史记定本》、《袁氏政书》、《两行斋集》、《宝坻劝农书》、《袁了凡家训》、《袁了凡纲鉴》、《群书备考》、《石经大学解》、《历法新书》、《中庸疏意》、《摄生三要》等。
或曰了凡生卒为1533-1606,或1546-1618。其寿74或确。